タンパク質構造予測AIモデル「AlphaFold3」のオープンソース実装がついに公開される

タンパク質やその他の生命分子の構造を予測するGoogle DeepMindのAIモデル「AlphaFold 3」がオープンソースで実装され、進行中の研究プロジェクトがGitHubで公開されました。

GitHub - Ligo-Biosciences/AlphaFold3: Open source implementation of AlphaFold3
https://github.com/Ligo-Biosciences/AlphaFold3

Show HN: An open-source implementation of AlphaFold3 | Hacker News
https://news.ycombinator.com/item?id=41448439

AlphaFold 3は分子同士の何百万もの組み合わせにより成り立つ生命の構造と相互作用を予測するAIモデルで、医薬品開発やゲノミクス研究などの分野で活躍することが期待されています。発表当初から、公開サーバーを通じてほとんどの機能が無料で使用可能でした。

Google DeepMindがすべての生命分子の構造と相互作用をきわめて正確に予測できるAIモデル「AlphaFold 3」を発表 - GIGAZINE

ところが、AlphaFold 3が発表された当初は、モデルのコードが公開されていないため、正確性や再現性に関する疑問が寄せられていたそうです。

開発チームはAlphaFold 3の機能を順次オープンソース化することで、完全なオープンソース実装に向けて研究を進展させ、コミュニティ全体が自由に使用できるようにすることを望んでいます。

AlphaFold 3はApache 2.0ライセンスの下で公開されています。まずは一本鎖タンパク質でトレーニングされたモデルがリリースされ、今後さらに機能を追加する予定とのこと。コードに加えて「重み」も公開される予定です。

開発チームは「AlphaFold 3の応用範囲は広大で、CRISPR遺伝子編集技術に使用したり、薬剤ががんにどのように結合するかを予測したりすることができます。今のところリポジトリの主な用途は研究開発ですが、リガンドタンパク質、核酸予測機能の準備が整い次第、将来的にユーザー向けの機能を追加する予定です」と語りました。